計算科学事業部
HPCチューニングサービス
論文よりスクラッチから並列化コーディング、および既存コードの高度並列化まで請け負います。 カタログOpenMP+MPIの事例・実績 電子状態計算コード（OpenMX+ESM)の高度並列化
SSE/AVX/GPGPU化の事例・実績 Proceeding
XA-CHEM-SUITE
量子化学／分子シミュレーション分野のソフトウェアです。 カタログ 機能・パフォーマンス試用版に興味がある方も含めinfo*x-ability.jp (* -> @)にお問い合わせください。
XA-SSE-QM (Version 1.0.10):
量子化学計算加速用SSE汎用モジュール(Linux x86_64動作済)XA-AVX-QM (Version 1.0.10):
量子化学計算加速用AVX汎用モジュール(Intel SandyBridge, Linux x86_64動作済)XA-CUDA-QM (Version 1.0.10):
量子化学計算加速用GPGPU汎用モジュール(NVIDIA GPU, Linux x86_64動作済)特徴 : GAMESS-USにアドオンできます。また、CPU版の通常ソフトと同じ使い方、入力ファイルに対応し、SCF/構造最適化が加速します。
参考文献 : Yasuda, K. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1230-1236
導入方法 (事前に加速対象の量子化学ソフトウェアのソースコードライセンスはご入手ください)
# ソフトウェアライセンスのみ購入する場合
NVIDIA GPUの搭載したマシンにdriver,toolkit,sdk(無料)をいれていただき、GAMESS-US & XA-CUDA-QM(特定フォルダにバイナリ置いてシンボリックリンクをはる)のセットアップをしていただくだけです。 ※スクリプト実行＋αでインストール可能です
# ハードと併せて購入する場合
GPU単体またはGPU搭載デスクトップコンピュータであれば弊社より２週間程度、
高性能計算サーバであればサーバベンダを経由して販売いたします。
サーバベンダはご希望のベンダをご紹介いただく場合、こちらからご紹介する場合、どちらも可能です。
XA-PIO :
量子化学計算による相互作用視覚化モジュール(Linux x86_64動作済)特徴 : Gaussian/GAMESS-USの出力を読み込むことで、 部分間の相互作用の起源を軌道相互作用に基づいて見通しよく理解することができます。
参考文献 : Fujimoto, H.; Koga, N.; Fukui, K. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 7452.
Winmostar/TencubeでPIO出力を描画しました
XA-ER :
エネルギー表示法による自由エネルギー計算モジュール(Linux x86_64動作済)特徴 : CPUで動作する高速かつ高精度な自由エネルギー計算が可能です。
参考文献 :
Matubayasi and Nakahara, J.Chem.Phys. 2000, 113, 6070-6081
Matubayasi and Nakahara, J.Chem.Phys. 2002, 117, 3605-3616
Matubayasi and Nakahara, J.Chem.Phys. 2003, 119, 9686-9702
テンキューブ研究所開発ソフトウェア
直観的で軽いWindows用の分子モデリングソフトウェアです。XA-CHEM-SUITEもコールできます。弊社は代理店ではありませんので、直接下記リンクより入手またはご購入ください。
Winmostar:
アカデミックフリー版です。 ダウンロードサイトTencube/WM:
商用版です。 購入サイトAllinea DDT
MPI/CUDA対応のGUIデバッガです。WindowsコンソールからマスターノードからX-terminalを受けてデバッグ可能です。 オークリッジ国立研究所など、海外の多数の機関には定評があります。XA-CHEM-SUITEの開発にも活用しています。 パンフレットAllinea社のウェブサイトに登録することで30日トライアル版をダウンロード可能です。 インストールも簡単で、直感的に扱えます。弊社は日本の代理店で、年間ライセンスとなります。
ご購入希望の方はお問い合わせください。
- Workstation License (Linux x86_64動作確認済)
- Cluster License (Linux x86_64動作確認済)
- Floating License (Linux x86_64動作確認済)